Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TXNRD1Q16881 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNRD1Q16881 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms