Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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NEDD8Q15843 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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NEDD8Q15843 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NEDD8Q15843 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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