Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCOA1Q15788 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCOA1Q15788 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms