Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHPRHQ149N8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHPRHQ149N8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
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