Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL19A1Q14993 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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COL19A1Q14993 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL19A1Q14993 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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