Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMAD4Q13485 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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