Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CNTN1Q12860 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CNTN1Q12860 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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