Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PIGFQ07326 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PIGFQ07326 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms