Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PAX8Q06710 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms