Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms