Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLTCQ00610 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLTCQ00610 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms