Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFAMQ00059 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms