Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2IP78347 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms