Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VEGFBP49765 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms