Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KDM5CP41229 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms