Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNCAP37840 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms