Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LTBRP36941 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBRP36941 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LTBRP36941 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBRP36941 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms