Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COPB2P35606 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COPB2P35606 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COPB2P35606 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COPB2P35606 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPB2P35606 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms