Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXD12P35452 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms