Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD40LGP29965 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms