Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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HOXD10P28358 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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