Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRGP23470 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
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