Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP2B1P20020 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2B1P20020 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms