Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EGR1P18146 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EGR1P18146 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EGR1P18146 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms