Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VSIG8P0DPA2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VSIG8P0DPA2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms