Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms