Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGA3P0DJD8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms