Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGPD1P0DJD0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGPD1P0DJD0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms