Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXB7P09629 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXB7P09629 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms