Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACAA1P09110 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAA1P09110 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms