Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCCAP05165 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCCAP05165 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCCAP05165 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCCAP05165 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCCAP05165 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCCAP05165 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCCAP05165 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCCAP05165 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms