Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms