Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ABCC9O60706 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC9O60706 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms