Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNQ2O43526 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms