Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVV-2B6SEH9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms