Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
B4DXG7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
B4DXG7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DXG7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms