Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID3CA6NKF2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms