Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAMTA1Q9Y6Y1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms