Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LEMD3Q9Y2U8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms