Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms