Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZMYND8Q9ULU4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms