Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN8Q9UBY8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms