Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLKQ9UBT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLKQ9UBT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms