Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM7SF3Q9NS93 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms