Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms