Protein–RNA interactions for Protein: Q9H772

GREM2, Gremlin-2, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM2Q9H772 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREM2Q9H772 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREM2Q9H772 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREM2Q9H772 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREM2Q9H772 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREM2Q9H772 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREM2Q9H772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms