Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH6AQ9H0K4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms