Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R3Q9BXE9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms