Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD1Q99460 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms