Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms